西南大學科研團隊繪就家蠶超級泛基因組圖譜

中國教育報-中國教育新聞網(wǎng)訊（記者 胡航宇）10月9日，西南大學發(fā)布最新科研成果，家蠶基因組生物學國家重點實驗室團隊歷時四年，完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析（“千蠶基因組”），繪就家蠶超級泛基因組圖譜。該研究在世界上率先實現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化，創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”，對于深化功能基因組研究和推進家蠶模式化，開啟家蠶設(shè)計育種，賦能“改造家蠶、多元利用”等，將產(chǎn)生深遠的影響。

家蠶是重要的經(jīng)濟昆蟲和新興模式生物，但之前僅有單一參考基因組及部分重測序，尚不足以支撐基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘。家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席科學家代方銀教授介紹，研究團隊對1078份蠶種質(zhì)資源（205份地方種，194份改良種，632份遺傳材料，47份野桑蠶）進行了深度測序，產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù)，組裝了545個蠶的高質(zhì)量基因組，對100個基因組進行了基因注釋，鑒定到4300余萬個SNP、930余萬個InDel、340余萬個結(jié)構(gòu)變異（SV）和7308個新基因（家族），繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。

該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息，是迄今全球動植物領(lǐng)域最大的長讀長泛基因組。同時，對蠶的各種遺傳變異、群體結(jié)構(gòu)、人工選擇和生態(tài)適應(yīng)性及經(jīng)濟性狀開展了深入的研究，取得豐碩的創(chuàng)新結(jié)果。其研究論文于今年9月24日在國際名刊《自然通信》（Nature Communications）在線發(fā)表。